У 2009 році між Університетом та ВМО був підписаний Меморандум про взаєморозуміння (Меморандум), завдяки якому стало можливим вести плідну співпрацю через здійснення на світовому рівні навчання в митній справі, освітньої діяльності, інституційного розвитку та різноманітних досліджень. Відповідно до Меморандуму на базі Університету у 2010 році було створено Регіональний навчальний центр – міждисциплінарний центр університетського рівня для Європейського регіону ВМО, робота якого розпочалась 01 вересня 2010 року. Регіональний навчальний центр (РНЦ) є пілотною базою Європейського Регіону та унікальним Центром ВМО університетського рівня, в основу якого покладено три складові: навчально-методична, наукова й організаційна робота. Метою РНЦ є просування та підтримка впровадження політики ВМО на регіональному рівні; проведення навчальної експертизи через розвиток регіональної навчальної експертизи та розширення змішаної навчальної мережі; створення інтегрованої системи підготовки та підвищення кваліфікації митників під егідою ВМО, проведення наукових досліджень в галузі митної справи.

Основними напрямками роботи РНЦ на університетському рівні є:

• розвиток співпраці з іншими університетами;
• співробітництво з Міжнародною мережею митних університетів (INCU);
• участь в Робочих групах ВМО з розвитку лідерства та менеджменту демонстрація повного каталогу електронних модулів ВМО для регіональних заходів ВМО та інтеграція їх в дистанційні програми Університету;
• розробка подальших модулів для Європейського регіону ВМО;
• створення та підтримання куточку ВМО в бібліотеці РНЦ та електронної бібліотеки з митної справи;
• підтримка зв’язку між дослідниками Університету та INCU;
• підготовка тренерів у регіоні;
• розбудова Митного навчального полігону європейського зразка, проведення комунікативних заходів для суб’єктів зовнішньоекономічної діяльності України та іноземних суб’єктів з питань взаємодії митних адміністрацій і бізнесу та поширення світового досвіду ведення зовнішньої торгівлі в Україні.